故事的舞台是互联网(wǎng )系统发达的(🃏)都市「DEN CITY」。
　　在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技(jì )术构筑而成的(de )(🎡)被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的(de )决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却(què )出现了利用决斗来进行黑客行为(wéi )(🙀)的谜之黑客集团「海(🥫)诺因骑士团」。而他(tā )们(men )的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界(🍑)”毁灭。
　　然而在世界受到这(zhè )样的威胁时，有一名决(jué )斗者站了(le )出来。而他的(de )名字正是「Playmaker」。
　(🔙)　在那场传奇的战斗中，「Playmaker」(🎦)使用压(yā )倒性的决斗将「海诺因(❓)骑(📬)士团」打倒，成(chéng )功(gōng )(🍹)捕获(🏸)了「SOL技术社」(🐈)和「海诺因骑士团」都想要得手的迷(mí )之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而(ér )他的名字就在互联(🈺)网的世界中一瞬间变得(dé )声名远播，成为了传说。
　　而现在，作为「Playmaker」的正(🏓)体的某位高(🛫)中(zhōng )生藤木游(🥈)作，为了寻找过去发生的某件事(💍)件的真相，对再次在(zài )「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击......  以此为契机，命运的齿轮就此转动……
　　迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯(🍑)上「Link Vrains」的目的，以(👆)及隐藏在游作过去的真相(🚇)到底是———
　　所有(yǒu )的答案，都在(🗻)「Link Vrains」中