故事的(⛲)舞台是互联网系(xì )统发达的都市「DEN CITY」。
　　在(🔬)那里有经由巨(jù )型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成(chéng )的(de )被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验(🔊)到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却(què )出现了利用决斗来进行黑(🙄)客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团(tuán )」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们(🈁)的世界=电子界”毁灭。
　　然(rán )而在世(shì )界受到这样的(de )威(🚶)胁时，有一名决斗者站了(le )出来。而他的名(⏲)字正是(👌)「Playmaker」。
　　在那场传奇的(de )战(zhàn )斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因(❓)骑士团(🕺)」(💑)打倒，成(chéng )功捕获(huò )了「SOL技术社」和「海诺因骑士(shì )团」都想要得手(🐅)的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却(🍉)突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬(shùn )间(⏭)变得声名远播，成为了传说。
　　而现在，作为(🍂)「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的(🎛)某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海(🌥)诺因骑士团」展开了追击......  以此为契(📩)机，命运的齿轮就此转动……
　　迷之AI的真身，「海诺因骑士(🈲)团」盯上「Link Vrains」的目的，以及(🈵)隐藏在游作过去的真相到底是——(😞)—
　　所有的答案，都在「Link Vrains」中