故事的舞台是互联网系统发(fā )达的都市「DEN CITY」。
　　在那里有经由巨型企业(🌫)「SOL技术社」通过高度的网(🐿)络技(jì )术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中(😱)为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客(㊙)行为的谜之黑客集团「海诺因(yīn )骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子(zǐ )界”毁灭(💍)。
　　然而在世界受到这(zhè )样的威胁时，有一名决斗者站了出(chū )来。而他的(de )名字(zì )正是「Playmaker」。
　　在那场传奇的战斗中，「(⏳)Playmaker」使(shǐ )用压(🍺)倒性的决斗将「海诺因骑(📬)士团」打倒，成功捕获了「SOL技术(shù )社」和「海(hǎi )诺因骑(🈂)士团」都想要得手的迷之AI程序(🛃)。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而(🍝)他的名(míng )字就(👔)在互联网的世界中一瞬间(jiān )变得声名远播，成为了传说。
　　而(ér )现在，作为「Playmaker」的正(zhèng )体的某位高中生藤木游作，为(➿)了寻找过去发生的某件事件的真相(😯)，对再次在「VRAINS」出(chū )现的「海诺因骑士团」展开了追击(jī )(🈲)......  以此为(🙋)契机，命运(☔)的齿轮就此转动…(🏥)…
　　迷之AI的真身，「海诺(🈹)因骑士团」盯上「Link Vrains」的目(🔷)的，以及隐藏在(zài )游(yóu )作过(guò )去的真相到底是———
　　所有的答案，都在「(📑)Link Vrains」中