故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」(🔧)。
　　在那里有经由巨型(xíng )企业「SOL技术(shù )社」通过高度的网络技术构(🎩)筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了(le )利用决斗来进行黑客行为的谜之黑(🎾)客集团(🍄)「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网(wǎng )的(🤖)某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。
　　然而在世(👪)界受到这样的威胁时，有(yǒu )一名决斗者站了出来。而(🔍)他(tā )的(de )(🤥)名字正是「Playmaker」。
　　在那场传奇的战斗(dòu )中，「Playmaker」使用(🚻)压倒性的决斗将「海诺因(yīn )骑士团」打倒，成(chéng )功捕获(huò )了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程(🙅)序(xù )。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名(míng )字就在互联网的世界中一瞬间变(biàn )得声(shēng )名(🐑)远播，成为了传说。
　　而(🎆)现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生(shēng )藤(téng )木游作，为(➿)了寻(💘)找过去发生的某(🍆)件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺(nuò )因骑士团」展开了(le )追击......  以此为契机，命运的(📧)齿轮就此转动…(🏥)…(🤯)
　(😋)　迷之AI的真身，「海诺(🈹)因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作(zuò )过去的真相到底是——(😞)—
　　所有的答案，都在「Link Vrains」中