故事的舞台是互联网系统发达(dá )的都市「DEN CITY」。
　　在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络(luò )(🕔)技术构筑(🤷)而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中(zhōng )为体验到全新的决斗而狂热(rè )。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决(jué )斗来进(jìn )行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存(🥕)在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界(jiè )”毁(huǐ )灭(miè )。
　　然(rán )而在世界受到这样的威(🚶)胁时，有一(yī )名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。
　　在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗(dòu )将「(🧘)海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺(🌲)因骑士团」都想要得手的迷之(✒)AI程序。一度拯(🎞)救了(📯)世界，然后却突然消声匿迹了，而(🍝)他的名字就(jiù )在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成(👡)为(👧)了传(🕤)说。
　　而现在(zài )，作为「Playmaker」的正体的某(🔡)位高(🛫)中生(🏫)藤木游作，为了寻找过去发生的(de )某(mǒu )件事件的真相(😯)，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因(🕶)骑士团」(🚖)展开了追击......  以此为契机，命运的齿轮就此转动…(🏥)…
　　迷之AI的真身(🀄)，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去(qù )的真相到底是———
　　所有的答案，都在「Link Vrains」中