本作品舞台设定于(yú )前作一万二千年后(🍩)的世界。作为普通市民的阿玛(mǎ )塔‧(🔧)空，在(zài )播(bō )放《Aquaria舞动于空》的戏院(yuàn )中遇到看一次就迷(mí )上电影(yǐng )的御子乃(🎩)‧铃白，二人后来(lái )(🙍)亦因为这个(🛹)话题而开始到(🛺)城中闲逛。这时候，Altair界向他们生活的城镇进行两年来几乎没有停(🛑)过(⏯)的攻击，不同的是今次出现了新型Abductor，令人类一方——由圣天使学园学生操控的(🚻)机械天使Aquaria没(méi )法招架。战火很快波及到刚刚认识的二人，阿玛塔在危急关头(tóu )使用身体潜在的Element能力飞走，却又突然被Aquaria系统选中为Vector Z驾驶员……终(📐)焉所引