本作品舞台设定于前(✒)作一万(📼)二千年后的世界。作为普(pǔ )通市民的阿玛塔‧空，在播放《Aquaria舞动于空》的戏(xì )院中遇(❣)到看(kàn )一次就迷上电影的御子乃(nǎi )‧铃白，二人后来亦因为这个话题而开始到城中闲逛。这时候，Altair界(🕕)向他们生活的城镇进行两年来几乎没有停过的攻击，不同的是今次出现了新型Abductor，令人类一(yī )方——由圣天使学园学生操(cāo )(🧤)控的机械天使Aquaria没法招架。战火很快波及到刚(gāng )刚认(💝)识的二(🏉)人，阿玛塔在危急关头使用身体潜在的Element能(💹)力飞走，却又突然被Aquaria系统选中(👌)为(💏)Vector Z驾驶员(yuán )……终焉所引